作為大熊貓基因組研究計劃的一部分,四川臥龍大熊貓研究中心的科研人員為大熊貓提取血液樣本(攝于2008年3月20日)。新華社記者 劉大偉 攝
四川臥龍大熊貓研究中心一只大熊貓在小雨中打盹(攝于2008年3月21日)。對大熊貓基因組的解讀,可以解釋諸如大熊貓為什么是“黑眼圈”之類(lèi)的難題。新華社記者 劉大偉 攝
新華網(wǎng)深圳10月11日電 題:科學(xué)家繪制完成世界首張大熊貓基因組序列圖譜
記者 彭勇
中國科學(xué)家11日在深圳宣布:世界首張大熊貓基因組序列圖譜繪制完成?茖W(xué)家們說(shuō),它將為保護和人工繁育這個(gè)被稱(chēng)為“中國國寶”的瀕危物種提供新的途徑,以及推進(jìn)針對大熊貓的其他科學(xué)研究。
今年3月,由中國科學(xué)家發(fā)起,加拿大、英國、美國、丹麥等國科學(xué)家聯(lián)合參與的國際“大熊貓基因組研究”項目啟動(dòng),繪制大熊貓基因組序列圖譜是該項目的第一部分,深圳華大基因研究院承擔了主要的工作任務(wù)。
大熊貓為什么是“黑眼圈”?為什么對竹子情有獨鐘?熊貓和狗熊是近親嗎?未來(lái)的大熊貓會(huì )是什么模樣?中國科學(xué)家為從基因組的水平上回答這些“棘手”問(wèn)題,挑選了大熊貓“晶晶”進(jìn)行基因組測序,“晶晶”是2008年北京奧運會(huì )吉祥物的原型之一,一直生活在成都大熊貓繁育研究基地。
“我們的研究工作量巨大,如果將大熊貓基因組序列寫(xiě)成一本書(shū),其厚度相當于384米高的深圳地王大廈!鄙钲谌A大基因研究院的王俊博士說(shuō)。
他說(shuō):“經(jīng)研究發(fā)現,大熊貓共有21對染色體,基因組大小與人類(lèi)相似,約為30億個(gè)堿基對,包含2-3萬(wàn)個(gè)基因!
科學(xué)家們采用了一種最新的測序技術(shù)繪制大熊貓基因組序列圖譜,使測序的速度顯著(zhù)提高,成本大大降低。據稱(chēng),這是全世界第一個(gè)采用這項新技術(shù)完成的標志性大型基因組序列圖譜,華大基因研究院自主研制的全基因組組裝軟件及自主搭建的高性能計算機,在其中發(fā)揮了關(guān)鍵性的作用。
王俊說(shuō),基因組測序的結果支持了“大熊貓是熊科的一個(gè)亞種”的觀(guān)點(diǎn)。通過(guò)與已經(jīng)進(jìn)行過(guò)全基因組測序的物種比較,研究人員還發(fā)現大熊貓基因組與狗的基因組在結構上最為接近,與人也有較大的相似性,在哺乳動(dòng)物中與小鼠差異較大。
科學(xué)家們透露,有關(guān)方面的深入研究正在進(jìn)行中。
科學(xué)家們表示,大熊貓基因組序列圖譜的繪制完成,有助于從基因角度破解為何熊貓繁殖能力低下的疑問(wèn),從而使科學(xué)家有機會(huì )幫助繁育更多的熊貓。
成都大熊貓繁育研究基地研究中心主任侯蓉說(shuō):“我們相信,大熊貓基因組的研究將為瀕危物種的保護和人工繁育提供新的途徑!
深圳華大基因研究院理事長(cháng)、中國科學(xué)院院士楊煥明說(shuō),深圳華大基因研究院將在今年年內完成大熊貓基因組的精細圖,并與各合作單位一道在基因組的水平上對大熊貓開(kāi)展系統研究。
他表示,經(jīng)過(guò)中國科學(xué)家的不懈努力,并通過(guò)積極參與國際性的基因研究,中國的基因研究和測序水平將不斷提高,目前基因研究國際合作的大門(mén)依然敞開(kāi),中國歡迎更多國家的科學(xué)家參與進(jìn)來(lái)。
自1999年正式加入“國際人類(lèi)基因組計劃”以來(lái),中國科學(xué)家先后參與了“國際人類(lèi)基因組計劃”“國際人類(lèi)單體型計劃”等項目,同時(shí)對完成數個(gè)重要動(dòng)植物基因組圖譜繪制,包括水稻、家蠶、家雞、家豬等作出了重要貢獻。2007年10月,第一個(gè)完整中國人基因組圖譜成功繪制完成。
大熊貓基因組序列圖譜的繪制是這一系列努力的最新成果,中國科學(xué)家的遠期目標是選取動(dòng)物、植物和微生物的代表物種進(jìn)行基因組測序,為外界描繪一副完整、絢麗的“生命之樹(shù)”圖景。
參與這項研究工作的還有深圳大學(xué)、中國科學(xué)院北京基因組研究所、中科院昆明動(dòng)物研究所、中科院動(dòng)物研究所、成都大熊貓繁育研究基地、中國大熊貓研究中心、復旦大學(xué)、香港大學(xué)等。據悉,與南開(kāi)大學(xué)聯(lián)合執行的大熊貓蛋白質(zhì)組功能與結構的研究計劃也即將啟動(dòng)。
目前,世界上的野生大熊貓僅存約1590只,主要分布在中國四川省周?chē)某缟骄䦷X之中,被稱(chēng)為“活化石”。另外,截至2007年底,中國人工圈養大熊貓種群數量達239只。